一、常溫保存
蜂王漿在常溫下的保質期僅僅只有3天，原因是蜂王漿對溫度、光照、空氣等非常敏感，例如在常溫下新鮮蜂王漿易因微生物大量繁殖而變質，因此新鮮蜂王漿要趁尚未變質之前及時食用完，或者將短時間吃不完的蜂王漿放到冰箱中冷藏保存，另外長途運輸新鮮蜂王漿時也要加冰袋來延長保質期。
二、混蜜保存
蜂王漿與蜂蜜混合后可保存1個月左右，原因是蜜蜂完全釀制成熟的蜂蜜富含抗菌成分，加之蜂蜜因濃度高而具有高滲透壓的特性，從而使得天然成熟蜜幾乎沒有嚴格的保質期，因此可利用蜂蜜的這一特性來延長蜂王漿的保質期，具體做法是將蜂王漿和蜂蜜按1:3混合并密封保存在避光陰涼的地方。
三、低溫保存
蜂王漿在低溫環境下保存可延長保質期，例如5℃時蜂王漿可保存3個月，0℃時蜂王漿可保存半年，-5℃時蜂王漿可保存一年，而-18℃時蜂王漿可保存兩年以上，因此蜂王漿規模化生產時都是冷凍保存，其中最為人們所熟知的是蜂王漿凍干粉，事實上蜂王漿凍干粉就是蜂王漿脫水冷凍后制成的。
總結：蜂王漿的保質期因保存方式不同而不同，其中常溫下新鮮蜂王漿僅僅只能保存3天，與蜂蜜混合并避光保存可延長至1個月，而脫水冷凍制成蜂王漿凍干粉則可保存2年以上。
