一、來源不同
蜂巢是由巢脾構成的，巢脾是用蜂蠟筑成的，蜂蠟來源于蜂群中適齡工蜂蠟腺的分泌物，也就是說蜂巢是蜜蜂用自身的分泌物筑成的，而蜂膠則是蜜蜂采集樹脂并混以上腭腺及蠟腺分泌物加工而成的，因此從來源上看二者就有明顯的區別，一個是蜜蜂自己分泌的，另一個是蜜蜂采集回來的。
二、作用不同
蜂巢和蜂膠對蜂群的作用不同，其中蜂巢是蜂群用來哺育幼蟲和儲存食物的，而蜂膠是蜂群用來修補蜂巢的，如果說蜂蠟是混凝土，那么蜂膠就像是鋼筋，另外蜂膠還是蜜蜂維持整個群體健康的有效物質，原因是蜂巢的環境非常適合微生物生存，沒有蜂膠抑制這些微生物則蜂群極容易患病。
三、成分不同
蜂巢和蜂膠在成分上也有著很大的區別，其中蜂巢的主要成分是蜂蠟，尚含少量的蜂蜜、蜂膠、蜂王漿、蜂花粉及蜂蛹衣等，而蜂膠是蜜蜂加工且成分極為復雜的物質，主要有樹脂、蜂蠟及多種蜜蜂分泌物，也就是說在蜂巢中含量最多的成分是蜂蠟，但是在蜂膠中含量最多的成分卻是樹脂。
四、功效不同
蜂巢和蜂膠在功效上也有明顯的差異，其中蜂巢主要的功效有抗菌消炎、解毒止痛等，一般用于處理各種局部炎癥及外傷感染等(在養蜂生產中也常被用來熬制蜂蠟)，而蜂膠主要的功效有增強免疫、抗菌消炎、降脂降壓等，因此特別適合于免疫力低下、高血壓、高血脂、高血糖等人群服用。
總結：蜂巢和蜂膠是截然不同的兩種東西，但在蜂巢中含有極少量的蜂膠，實際上蜂膠和蜂蠟都是修筑蜂巢的材料，區別在于蜂群中蜂蠟的產量要遠遠高于蜂膠，也就是說蜂巢最主要的成分還是蜂蠟。
